[R-es] ¿Pasar parámetros por referencia?
On Wed, 28 Sep 2011 15:40:43 +0200,Servicio de EstadÃsticas Demográficas y Sociales <seds.ive en gmail.com> wrote:
[1 <text/plain; ISO-8859-1 (quoted-printable)>] Lo primero, muchas gracias por tus sugerencias. Voy a investigar el paquete ff a ver si asà lo resuelvo.
Pero he visto que luego comentas que los accesos a la matriz están escritos por otra persona. Usar ff requerirÃa que re-escribieras parte del código.
Sobre la segunda alternativa que apuntas, ¿puede modificarse parte de una matriz mediante assign o alguna función similar?
SÃ, claro, puedes hacer assign de lo que sea, en el environment que elijas (entiendo que te refieres al uso de variables globales). Pero el problema de creación de copias intermedias existe. Y en la asignación a matrices, y operaciones como x[, i] <- lo.que.sea puede haber muchas más copias intermedias de las que uno esperarÃa, incluyendo copias intermedias de la totalidad de x. El último libro de Chambers, creo, explica esto con cierto detalle. Vaya, toquetear cachos de matrices (y vectores) suele ser caro, sobre todo si se hace varias veces. R.
Saludos. Seds
El 28 de septiembre de 2011 14:17, Ramon Diaz-Uriarte <rdiaz02 en gmail.com>escribió:
On Wed, 28 Sep 2011 13:53:19 +0200,Servicio de EstadÃsticas Demográficas y Sociales <seds.ive en gmail.com> wrote:
[1 <text/plain (quoted-printable)>] ¿Hay alguna manera de pasar a parámetros por referencia?
El problema es que tengo una matriz muy grande (unos 6 Gb) que al pasarla como parámetro a una función (que, además debe modificarla) R
internamente
trata de copiarla y se genera un error de "imposible ubicar un vector de
6
Gb)
Hay varios paquetes en CRAN que implementan diversas formas de acceso por referencia. Pero, en tu caso, quizás el paquete "ff" (que deja las cosas en disco, y accede sólo ---pero de forma muy rápida--- a lo necesario) te sea más útil.
Aunque sé que no es buena práctica, también me valdrÃa si pudieran
definirse
variables "globales".
Puedes imitar parcialmente el comportamiento de variables globales usando las reglas del scope, si no redefines la variable en el conjunto de environments anidados, y si no la pasas como parámetro de tu función. Y pudes cambiar esas variables globales con assign, y similares. Pero generalmente suele dar lugar a código difÃcil de mantener y debuggear. Un saludo, R.
Un saludo. Seds
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[2 <text/plain; iso-8859-1 (quoted-printable)>]
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-- Ramon Diaz-Uriarte Department of Biochemistry Universidad Autónoma de Madrid Spain http://ligarto.org/rdiaz Temporarily at: Structural Biology and Biocomputing Programme Spanish National Cancer Centre (CNIO) Phone: +34-91-732-8000 ext. 3019 Fax: +-34-91-224-6972
[2 <text/html; ISO-8859-1 (quoted-printable)>]
Ramon Diaz-Uriarte Department of Biochemistry Universidad Autónoma de Madrid Spain http://ligarto.org/rdiaz Temporarily at: Structural Biology and Biocomputing Programme Spanish National Cancer Centre (CNIO) Phone: +34-91-732-8000 ext. 3019 Fax: +-34-91-224-6972