Hola,
este es el archivo que estoy usando, pero en ese creo que no he modificado
nada.
Me instalé las actualizaciones de todos los paquetes, quizá el problema
venga por ahÃ, que no sea de data.table sino de otro...
Gracias
Un saludo
MªLuz
El 1 de octubre de 2015, 14:34, Carlos Ortega <cof en qualityexcellence.es>
escribió:
Hola,
Ayer probé sobre Windows la 1.9.6 y me cargóel conjunto sin problemas.
Comentaste que habÃas manipulado el fichero y algo habÃas quitado, puede
que hayas cambiado el número de columnas en esa lÃnea y que ahora no tenga
las mismas que el resto y por eso fread da error.
Si puedes pasarnos tu fichero vemos si esto es asÃ...
Gracias,
Carlos Ortega
www.qualityexcellence.es
El 1 de octubre de 2015, 12:41, MªLuz Morales <mlzmrls en gmail.com>
escribió:
Hola de nuevo,
parece que la última versión del paquete data.table es 1.9.6
La he probado y parece que no funciona bien, me da error:
Error in fread("C:/Users/iphealthMariluz/Documents/Proyecto
iphealt/ProcesamientoTexto/Adverse Drug
Event/ADE-Corpus/DRUG-AE_eliminoLinea1856.rel") :
4 arguments passed to .Internal(nchar) which requires 3
El 30 de septiembre de 2015, 13:38, MªLuz Morales <mlzmrls en gmail.com>
escribió:
SÃ, me di cuenta de que el problema era |", y he hecho la sustitución.
Estoy usando la versión 1.9.4, sÃ. Voy a ver si consigo la versión
MuchÃsimas gracias a todos
Saludos
MªLuz
El 30 de septiembre de 2015, 12:51, Carlos J. Gil Bellosta <
cgb en datanalytics.com> escribió:
Si en la lÃnea 1856 de tus datos reemplazas
|"cotton-wool" spots|
por
|cotton-wool spots|
funciona (y fread lee todas las lÃnas).
Suena a bug en el paquete (porque las comillas que no son vecinas de
separador las gestiona correctamente).
Igual quieres comentarle al autor del paquete el problema para que le
eche un ojo. De todos modos, te recomendarÃa que comprobases el
problema también en la versión de desarrollo, la 1.9.5, por si ya se
ha arreglado. La actual (¿es la que usas?) es la 1.9.4.
Salud,
Carlos J. Gil Bellosta
http://www.datanalytics.com
El dÃa 30 de septiembre de 2015, 12:37, Carlos Ortega
<cof en qualityexcellence.es> escribió:
No sé... alguna explicación habrá...
¿Puedes pasarnos tu fichero para ver si lo importamos correctamente
nosotros?.
¿Puedes comprobar que tienes la última versión de data.table...?
Gracias,
Carlos Ortega
www.qualityexcellence.es
El 30 de septiembre de 2015, 10:37, MªLuz Morales <
Hola de nuevo,
el archivo .rel esta en una carpeta comprimida .zip, yo la
win rar. Como no sea ese el motivo por el que no me da el fichero
El 30 de septiembre de 2015, 10:30, MªLuz Morales <
Pues soy gafe entonces,
no lo entiendo:
datIn <- fread("C:\\Users\\iphealthMariluz\\Documents\\Proyecto
iphealt\\ProcesamientoTexto\\Adverse Drug
Event\\ADE-Corpus\\DRUG-AE.rel")>
El 29 de septiembre de 2015, 18:54, Carlos Ortega <
cof en qualityexcellence.es> escribió:
Y con fread.. directamente sobre el ".rel"...
datIn <- fread("DRUG-AE.rel")
dim(datIn)
[1] 6821 8
Saludos,
Carlos Ortega
www.qualityexcellence.es
El 29 de septiembre de 2015, 18:45, Pedro Concejero Cerezo <
pedro.concejerocerezo en telefonica.com> escribió:
No tiene cabecera. Tendrás que ponerle nombre a las variables
Prueba este código, yo leo 6821 obs. of 8 variables
library(data.table)
setwd("C:/Users/pedroc/Desktop/ADE-Corpus-V2") #Pon tu
trabajo
dat <- read.table(file = "DRUG-AE.rel",
sep = "|",
comment.char = "",
header = F,
quote = "")
str(dat)
datt <- data.table(dat)
El 29/09/2015 a las 17:31, Pedro Concejero Cerezo escribió:
Hola, M. Luz.
Hay infinidad de motivos por los que se te puede cortar la
un archivo de datos, pero los más habituales son encontrar un
en los registros, o una lÃnea toda en blanco.
Lo primero yo creo que es dejar el archivo en texto plano (lo
recomendaba Carlos de usar el original, no el docx), y buscar
caracteres con un editor de texto plano tipo Notepad. Los puedes
si no cumplen ninguna función.
Yo te recomiendo usar read.table que te permite configurar estos
detalles. En concreto:
comment.char = "" no te corta la lectura de fichero como si
comentario, te lo añade a la cadena (eso si quieres usar el
elimÃnalo)
quote = "" lo mismo con la comilla como comienzo de una cadena
Pero verás que hay muchÃsimas más opciones que te evitan que se
la lectura (blank lines, ...) o que te rellene con NA's si no
todas las columnas del header (flush = TRUE).
Luego pasas a data.table con data.table(objeto_que_has_leido) y
read.table(file, header = FALSE, sep = "", quote = "\"'",
dec = ".", numerals = c("allow.loss", "warn.loss",
"no.loss"),
row.names, col.names, as.is = !stringsAsFactors,
na.strings = "NA", colClasses = NA, nrows = -1,
skip = 0, check.names = TRUE, fill =
strip.white = FALSE, blank.lines.skip = TRUE,
comment.char = "#",
allowEscapes = FALSE, flush = FALSE,
stringsAsFactors = default.stringsAsFactors(),
fileEncoding = "", encoding = "unknown", text,
FALSE)
Saludos,
Pedro
=============
En respuesta a:
------------------------------
Message: 2
Date: Tue, 29 Sep 2015 16:55:05 +0200
From: MªLuz Morales <mlzmrls en gmail.com><mailto:
To: r-help-es <r-help-es en r-project.org><mailto:
r-help-es en r-project.org>
Subject: [R-es] sobre fread {data.table}
Message-ID:
<
CANmAToM+sRRTfOBRYsrgoUdxdXVtrk21_E7LE0rrb8ENmMiBqQ en mail.gmail.com
CANmAToM+sRRTfOBRYsrgoUdxdXVtrk21_E7LE0rrb8ENmMiBqQ en mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="UTF-8"
Buenas tardes,
intento almacenar el contenido de un archivo .docx en un
pero
solo me devuelve 1855 filas cuando deberñian ser 6821.
Sin embargo, el mismo archivo se me descarga completo usando
{qdapTools}, pero este devuelve un vector carácter y no es lo
quiero.
¿Alguien sabe donde puede estar el problema?
Nota: El docx procede de un archivo .rel que descargué de
cual
cambié la extensión por .doc y una vez abierto guardé como docx.
Gracias!!
Un saludo
MªLuz
--
Pedro Concejero
E-mail: pedro.concejerocerezo en telefonica.com<mailto:
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