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[R-es] Incongruencias entre ANOVA y comparación por pares

Hola.

La "incongruencia" puede deberse a que el test de Fisher y el de Tukey 
se calculan de manera diferente.
En este enlace explican esa y alguna otra  de las posibles causas:

http://www.pmean.com/05/TukeyTest.html

Otra de las posibilidades es que las diferencias entre algunas de las 
variedades sean casi marginales y que tras el ajuste de los p-valores 
para tener en cuenta los múltiples tests su significación sea > 0.05. 
Esto lo podrías comprobar usando la función TukeyHSD(), es decir, 
podrías comprobar qué variedades presentan una diferencia más "próxima a 
la significación" viendo cuáles de los "p.adj." están más próximos a 
0.05 (probablemente sean esos pares de variedades los que causan que el 
ANOVA sea significativo:

TukeyHSD(Za,"variety")



Marcelino.


El 20/02/2018 a las 13:48, Yesica Pallavicini Fernandez escribió: