[R-es] help - efecto aleatorio

Hola Carolina,


El tipo de diseño que utilizas es lo que se conoce como un cross-over
design (un sujeto es expuesto a dos o más tratamientos, o sea crosses-over
from one treatment to the other). Con esos diseños, es habitual incluir
efectos de "periodo" (el primero, el segundo, el tercero, en tu caso) y de
"carry-over effect" (el efecto residual de un tratamiento dado en el
momento k, sobre otro en el momento k+1). 


Hay bastante literatura sobre estos diseños. Empezaría por el fantástico
libro de Jones y Kenward "Design and analysis of cross-over trials", del
que hay una segunda edición. 


Centrado en estudios de comportamiento animal, escribí hace años una
revisión de los problemas del análisis inapropiado de estos diseños,
"Incorrect analysis of crossover trials in animal behaviour research",
Anim Behav 2002;63:815-822, doi:10.1006/anbe.2001.1950 ---google te
llevará al PDF---, y también una revisión de métodos. En este sentido, hay
un artículo reciente en Behavioral Ecology
(http://beheco.oxfordjournals.org/content/21/3/437.full) que alerta sobre
los carryover effects, etc.



En último término, probablemente quieras usar un modelo mixto (aunque, en
realidad, las distintas medidas del mismo individuo no son
"pseudoréplicas", en el sentido de Hurlbert). Pero, antes que eso,
pensaría en el modelo con carry-over effects y periodo.


Un saludo,


R.

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Hola a todos!

Tengo una duda respecto a la estructura del factor aleatorio que debo usar en un modelo lineal mixto.
Hice el siguiente experimento en nidos de aves:
Medí la intensidad de la respuesta agresiva de los dueños de los nidos frente a tres tipos intrusos (una especie control,  depredador 1 y depredador 2).
Cada nido/pareja fue expuesto a los tres intrusos el mismo día, uno a continuación del otro (con un intervalo de descanso entre presentaciones).  
Estos tratamientos se hicieron en dos etapas del ciclo de nidificación (Etapa 1 y Etapa 2). Los nidos/parejas no fueron utilizados en ambas etapas, son independientes.
Me interesa comparar la respuesta frente a los 3 modelos en cada etapa del ciclo y entre ambas etapas del ciclo.

El modelo que corrí es el siguiente: 

<-lme(ACPr~Intruso*Etapa+Date+Adultos+PV+MB,random=~1|ID,data=acp)
El efecto aleatorio que utilice  para contemplar las pseudoréplicas al medir al mismo individuo varias veces es la identidad del nido (ID) y tengo dudas respecto a si esto está bien así o me falta algo para obtener todas las comparaciones que necesito. 
Date, Adultos, PV, MB son co-variables.

Muchas graciasCarolina

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