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[R-es] Error: protect(): protection stack overflow

2 messages · Manuel Mendoza, Isidro Hidalgo

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Muy buenas, estoy aplicando random forest a una df de 256 filas y 54973
columnas y me quedo sin memoria. He probado con randomForest y con ranger,
y con los dos pasa. ¿Tenéis alguna solución para esto (que no sea comprarse
un ordenador más potente:-) ?. Pude aplicar XgBoost, incluso cerca de 2000
veces  (unas 16 horas), para optimizar los hiperparámetros con una rejilla
de búsqueda, pero XgBoost utiliza varios núcleos a la vez. No sé si hay
forma de hacer que randomForest o ranger utilicen más núcleos. Cualquier
otra solución sería buena, claro.
Gracias,
Manuel
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Buenos días :
Quizá lo mejor en tu caso es lanzar una regresión penalizada y eliminar algunas variables... ?
Saludos,

Isidro Hidalgo Arellano
Observatorio del Mercado de Trabajo
Junta de Comunidades de Castilla ? La Mancha

-----Mensaje original-----
De: R-help-es <r-help-es-bounces en r-project.org> En nombre de Manuel Mendoza
Enviado el: domingo, 28 de mayo de 2023 13:29
Para: Lista R <r-help-es en r-project.org>
Asunto: [R-es] Error: protect(): protection stack overflow

Muy buenas, estoy aplicando random forest a una df de 256 filas y 54973 columnas y me quedo sin memoria. He probado con randomForest y con ranger, y con los dos pasa. ¿Tenéis alguna solución para esto (que no sea comprarse un ordenador más potente:-) ?. Pude aplicar XgBoost, incluso cerca de 2000 veces  (unas 16 horas), para optimizar los hiperparámetros con una rejilla de búsqueda, pero XgBoost utiliza varios núcleos a la vez. No sé si hay forma de hacer que randomForest o ranger utilicen más núcleos. Cualquier otra solución sería buena, claro.
Gracias,
Manuel


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