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[R-es] Error read.csv

6 messages · Eduardo Bieñkowski, Carlos Ortega, Javier Marcuzzi +1 more

Original
Javier Marcuzzi
# 
Estimado Eduardo Bieñkowki

Esa cantidad de registros puede tener problemas, en algunas ocasiones son 
tontos, en otras oportunidades hay que "romper" la cabeza.

Supongamos que R no tiene problemas, que pasa algo antes y que R lo lee y no 
comprende algo en el archivo.

Algunos puntos para intentar
1) Esos datos están en una base de datos y fueron exportados a csv. ¿Tienen 
acceso a la base de datos?
2) Tienen acceso al archivo csv desde otro software (otro programa lo lee o 
también hay problemas). ¿Capacidad en la computadora?
3) Si puede abrir el archivo con otro software ¿puede copiar los primeros 
registros a otro csv y cargarlos con Rstudio o Rcmdr? La idea es que esté 
correctamente escrito, me refiero a la ruta, opciones ...
4) Hay registros en otra codificación, me refiero a una parte en urf-8 otra 
en escrita en mac, linux, windows, todo junto no se daría pero me paso de 
tener registros guardados en un sistema y al leerlos en otro hasta tenía 
problemas con la forma de finalizar la línea (renglónes, espacios...).
5) Aunque lo habrá leído ¿read csv 2? De pronto cambiar la forma de lectura, 
de alguna forma hacer ingresar los datos a R aunque sea desprolijo y 
requiera nuevo trabajo.

por las dudas:
read.table(file, header = FALSE, sep = "", quote = "\"'",
           dec = ".", row.names, col.names,
           as.is = !stringsAsFactors,
           na.strings = "NA", colClasses = NA, nrows = -1,
           skip = 0, check.names = TRUE, fill = !blank.lines.skip,
           strip.white = FALSE, blank.lines.skip = TRUE,
           comment.char = "#",
           allowEscapes = FALSE, flush = FALSE,
           stringsAsFactors = default.stringsAsFactors(),
           fileEncoding = "", encoding = "unknown", text)

read.csv(file, header = TRUE, sep = ",", quote = "\"",
         dec = ".", fill = TRUE, comment.char = "", ...)

read.csv2(file, header = TRUE, sep = ";", quote = "\"",
          dec = ",", fill = TRUE, comment.char = "", ...)

Javier Marcuzzi


-----Original Message----- 
From: Eduardo Bieñkowski
Sent: Friday, July 19, 2013 3:26 PM
To: r-help-es en r-project.org
Subject: [R-es] Error read.csv

Estimados
Tengo un archivo CSV con 1.200.000 registros separados por ";" y cuando
quiero abrirlo me da el siguiente error:

form<-read.csv("Usr1.csv" ,  sep=';' , na.strings = "NA", header=T)
Mensajes de aviso perdidos
In scan(file, what, nmax, sep, dec, quote, skip, nlines, na.strings,  :
entrada inválida encontrada en la conexión de entrada 'Usr1.csv'

Alguien me puede dar una pista?
Saludos
Javier Marcuzzi
# 
Estimado Eduardo

¿A que se refiere por visualizarlo?

El mensaje es por falta de memoria 
http://stackoverflow.com/questions/14719349/error-c-stack-usage-is-too-close-to-the-limit

Hay estrategias para casos de muchos datos, habría que buscar bigdata, 
bigmemory, cosas por el estilo, ver que se puede usar, por ejemplo sparce 
matrix en lugar de matrix, etc. Todo se complica.

Javier Marcuzzi

-----Original Message----- 
From: Eduardo Bieñkowski
Sent: Saturday, July 20, 2013 12:29 AM
To: Carlos Ortega
Cc: Lista R
Subject: Re: [R-es] Error read.csv

Siguiendo la sugerencia de Velez Jorge use read.delim2, lee y crea el
objeto pero al intentar visualizarlo me da el error:
Error: C stack usage is too close to the limit

Olvideo decir que corro R con Rstudio en Ubuntu 13.04
Gracias



El 19 de julio de 2013 15:36, Carlos Ortega 
<cof en qualityexcellence.es>escribió: