Gracias por sus comentarios: (nunca se si lo envÃo a toda la lista, al respecto me equivoque mil veces) El libro: Modeling survival data: extending the Cox model Terry M. Therneau, Patricia M. Grambsch No está a mi alcance, y es muy difÃcil de comprar (ahora en Argentina hasta hay problemas para importar Biblias, burocracias polÃticas, mi mamá tiene librerÃa). El libro; A Handbook of Statistical Analyses Using R, Second Edition [Paperback] Brian S. Everitt (Author), Torsten Hothorn (Author) Por suerte sà está a mi alcance, pude leer el capitulo correspondiente. Dentro de sus recomendaciones leà biograph y pensaba "en que lÃo me habré metido". Pero creo que podre salir a flote, no busco un análisis muy complicado, en primera instancia el tratamiento depende del anterior pero siempre es el mismo. Cuándo pensé en Survival también pensaba en Cox, hay otras formas pero no estoy realizando algo para estadÃsticos, el resultado final es "en porcentaje", es: esto (tratamiento) es un x % y por cada dÃa los % (si o no) varÃan de la siguiente forma. Yo soy veterinario, esto es sobre veterinaria a campo y con vacas, mi jefe me dijo, ni idea de eso pero que se entienda. Por lo cuán la salida de un gráfico con las lÃneas a lo largo del tiempo, es lo que se necesita por un lado, y por el otro es: de estos dos tratamientos, este explica en un 10% y este en un 5%, ese punto me falta estudiar, tengo dudas (desconocimiento) sobre sobre las salidas de resultados por parte de R (tengo que estudiarlo y aprenderlo). Creo que es correcto pensar en la librerÃa survival porque el tratamiento es siempre igual, es a lo largo del tiempo (repeticiones) y el resultado es si o no (cambia el número de repeticiones y dÃas). Gracias a los tres por sus aportes, intentaré y cualquier cosa consulto nuevamente al conocimiento y experiencia de ustedes. Javier -----Mensaje original----- From: Ivonne Pacheco Sent: Friday, October 07, 2011 7:26 AM To: Marcuzzi, Javier Rubén Subject: Re: [R-es] Survival Hola Javier, Tuve mas o menos los mismos inconvenientes para preparar los datos y utilizar survival, pero este libro me ayudó mucho: Modeling survival data: extending the Cox model Terry M. Therneau, Patricia M. Grambsch En el capÃtulo 8 tiene un apartado donde explica cómo deben estar preparados los datos para cada tipo de modelo. Espero te sirva. Un saludo, **** Ivonne Pacheco GarcÃa **** El dÃa 6 de octubre de 2011 17:00, Marcuzzi, Javier Rubén <javier.ruben.marcuzzi en gmail.com> escribió:
Hola a todos:
Estoy comenzando a utilizar la librerÃa survival, mi experiencia al
respecto es nula.
El material que leo y los ejemplos son entendibles, pero tengo una duda
respecto a como preparar mis datos antes de utilizar la librerÃa.
Mis datos (los cuales yo mido a campo y puedo escribirlos en la base de
datos, planilla de cálculo, como yo quiera) son el seguimiento a lo largo
del tiempo de ciertas cosas que van pasando.
Básicamente tengo el individuo, la fecha de inicio del protocolo, cuatro o
cinco tratamientos, y el resultado (si o no). Cabe aclarar que el
resultado puede ser al primer tratamiento, segundo tratamiento, al
producirse el resultado no se realiza el siguiente tratamiento (no
enveneno a nadie, pero es comparable, si está muerto no doy más veneno).
También conozco la fecha de nacimiento, podÃa tener la edad a cada tiempo.
Mi duda es porque leo los ejemplos y los datos ya están acomodados, o muy
próximo a lo necesario para el procesamiento del modelo en R. No se a
ustedes, pero para a mi muchas veces es más el tiempo que me lleva
acomodar los datos (dentro o fuera de R) que el que me lleva pensar y
hacer el modelo estadÃstico.
Lo que yo pensé es almacenar los registros de una forma muy sencilla, las
columnas serÃan las siguientes:
Individuo, fecha, lo que paso.
Y en la columna ?lo que paso? usar palabras como, ?nacimiento?, ?inicio de
protocolo?, ?tratamiento?, ?resultado?.
QuedarÃa algo como (las fechas son cualquiera)
javier 17/11/00 nacimiento
javier 27/12/01 inicio protocolo
javier 08/03/02 tratamiento
javier 20/09/03 tratamiento
javier 30/04/04 resultado
Mirando ejemplos, las columnas preparadas son serÃan algo como:
individuo fecha tratamiento resultado
O
Individuo entre fechas resultados
La libreria survival tiene el siguiente ejemplo:
fit <- coxph(Surv(time1, time2, status) ~ age + creatinine, data=mydata)
subject time1 time2 status age creatinine . . .
1 0 15 0 25 1.3
1 15 46 0 25 1.5
1 46 73 0 25 1.4
Yo no puedo contemplar esa forma porque mis datos no tienen un ?entre tal
y tal fecha?. (me es muy importante conocer si fue al dÃa 22 o 23, por
ejemplo)
SerÃan algo como:
subject time status ( status es si o no para la fecha o dÃa time).
NecesitarÃa algo de información como para leer un poco más o comentarios
de experiencia de algunos de ustedes sobre survival y R. Principalmente a
como ir preparando los registros para ser eficiente y no perder tiempo,
llevo más de 5000 renglones pasados y no me gustarÃa tener que rehacer mi
trabajo por almacenar de forma incorrecta la información. Tengo dudas
sobre como preparar los registros para importar y/o procesar en R antes de
escribir el modelo para la librerÃa Survival.
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