local maxima positions in a vector with duplicated values
Your original query included
> x <- c(1,0,0,0,2,2,3,4,0,1,1,0,5,5,5,0,1)
... I need 8 10 13.
Did you also want the 1's at the ends to count as local maxima,
so the result would be c(1,8,10,13,17)?
Or do you want the maxima at endpoints only if there are no others?
-BIll
On Mon, Mar 29, 2021 at 8:56 AM Stefano Sofia
<stefano.sofia at regione.marche.it> wrote:
Thank you Bill, your tip solved everything.
Stefano
(oo)
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Stefano Sofia PhD
Civil Protection - Marche Region - Italy
Meteo Section
Snow Section
Via del Colle Ameno 5
60126 Torrette di Ancona, Ancona (AN)
Uff: +39 071 806 7743
E-mail: stefano.sofia at regione.marche.it
---Oo---------oO----------------------------------------
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Da: Bill Dunlap [williamwdunlap at gmail.com]
Inviato: luned? 29 marzo 2021 17.22
A: Stefano Sofia
Cc: bgunter.4567 at gmail.com; minshall at umich.edu; r-help mailing list
Oggetto: Re: [R] local maxima positions in a vector with duplicated values
If you want to accept maxima at the ends of the series, append -Inf to
each end and subtract one from the result. Note that this will make
even a constant sequence have a local maximum at 1.
On Mon, Mar 29, 2021 at 6:52 AM Stefano Sofia
<stefano.sofia at regione.marche.it> wrote:
Dear Bill, Bert, Greg and Abby,
I tested your code (honestly apart from Abby's solution because it needed an additional package and I run R in a server which is not administrated by myself), they work and I found them equivalent. (Probably Bill's and Greg's solutions are a bit faster than Bert's.)
In my real application I found a case where none of them work: when the series is monotonic. In this case the last number of the vector (or the last duplicated numbers) is not a maximum but it is anyway the highest number of the vector:
x <- c(1,1,1,2,2,3,4,4,4,5,6,6,6)
The error is: argument is of length zero.
Your code is at the moment too complicated for me to modify. I ask if there is an "easy" extension of the code that you kindly wrote for me to handle also this possibility.
Thank you for everything
Stefano
(oo)
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Da: Bill Dunlap [williamwdunlap at gmail.com]
Inviato: venerd? 26 marzo 2021 18.40
A: Stefano Sofia
Cc: r-help mailing list
Oggetto: Re: [R] local maxima positions in a vector with duplicated values
Using rle() may make it easier - finding the peak values is easier and
select from cumsum(lengths) to get the positions of the last values
before the peaks, then add 1. I have not tested the following very
much.
function(x) {
rx <- rle(x)
cumsum(rx$lengths)[c(diff(diff(rx$values)>0) == -1,FALSE,FALSE)]+1
}
-Bill
On Fri, Mar 26, 2021 at 8:36 AM Stefano Sofia
<stefano.sofia at regione.marche.it> wrote:
Dear list users,
I need to find local maxima and local minima positions in a vector where there might be duplicates; in the particular in case of
- duplicated local maxima, I should take the position of the first duplicated value;
- duplicated local minima, I should take the position of the last duplicated value.
Example:
x <- c(1,0,0,0,2,2,3,4,0,1,1,0,5,5,5,0,1)
which(diff(diff(x)>=0)<0)+1
gives me 8 11 15 while I need 8 10 13;
which(diff(diff(x)>0)>0)+1
gives me 4 6 9 12 16 while I need 4 9 12 16.
Could you please help me in this task? I would be happier not to use additional packages.
Thank you for your precious help
Stefano
(oo)
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and provide commented, minimal, self-contained, reproducible code.
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