Thanks,
Jeff
\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/
R_GLMM = glmer(cbind(SdlFinal, SdlMax-SdlFinal) ~
lnsdlmaxd*lnadultssdld +
?(1|ID),data=sdlPCAdat,family="binomial")
Generalized linear mixed model fit by the Laplace approximation
Formula: cbind(SdlFinal, SdlMax - SdlFinal) ~ lnsdlmaxd * lnadultssdld
+
(1 | ID)
? Data: sdlPCAdat
?AIC ?BIC logLik deviance
?1150 1165 ? -570 ? ? 1140 ? ? ? ?<------------------ this line!!
Random effects:
?Groups Name ? ? ? ?Variance Std.Dev.
?ID ? ? (Intercept) 1.2491 ? 1.1176
Number of obs: 144, groups: ID, 48
Fixed effects:
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? Estimate Std. Error z value Pr(>|z|)
(Intercept) ? ? ? ? ? ? 4.56964 ? ?0.43148 ?10.591 ?< 2e-16 ***
lnsdlmaxd ? ? ? ? ? ? ?-0.65936 ? ?0.05686 -11.595 ?< 2e-16 ***
lnadultssdld ? ? ? ? ? -0.64534 ? ?0.15861 ?-4.069 4.73e-05 ***
lnsdlmaxd:lnadultssdld ?0.07393 ? ?0.02166 ? 3.414 ?0.00064 ***
---
Signif. codes: ?0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
Correlation of Fixed Effects:
? ? ? ? ? ?(Intr) lnsdlm lndlts
lnsdlmaxd ? -0.923
lnadltssdld -0.461 ?0.479
lnsdlmxd:ln ?0.482 -0.508 -0.994
?\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/\/
title 'SAS GLMM';
proc glimmix data=sdlPCAdat ic=pq noitprint method=laplace; class site
id; model sdlfinal/sdlmax = lnsdlmaxd|lnadultssdld/ solution
dist=binomial; random ID /; covtest glm/wald; run;
//////////////////////////////////////////////////////////////////////
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?SAS GLMM ? ? ?19:36 Wednesday, June 30, 2010 88
? ? ? ? ? ? ? ? ? The GLIMMIX Procedure
? ? ? ? ? ?Data Set ? ? ? ? ? WORK.SDLPCADAT
? ? ? ? ? ?Response Variable (Events) ?SdlFinal
? ? ? ? ? ?Response Variable (Trials) ?SdlMax
? ? ? ? ? ?Response Distribution ? ? Binomial
? ? ? ? ? ?Link Function ? ? ? ? Logit
? ? ? ? ? ?Variance Function ? ? ? Default
? ? ? ? ? ?Variance Matrix ? ? ? ?Not blocked
? ? ? ? ? ?Estimation Technique ? ? Maximum Likelihood
? ? ? ? ? ?Likelihood Approximation ? Laplace
? ? ? ? ? ?Degrees of Freedom Method ? Containment
? ? ? ? ? ? ? ? ?Optimization Information
? ? ? ? ? ? Optimization Technique ? ?Dual Quasi-Newton
? ? ? ? ? ? Parameters in Optimization ?5
? ? ? ? ? ? Lower Boundaries ? ? ? 1
? ? ? ? ? ? Upper Boundaries ? ? ? 0
? ? ? ? ? ? Fixed Effects ? ? ? ? Not Profiled
? ? ? ? ? ? Starting From ? ? ? ? GLM estimates
? ? ? ? ? ? Convergence criterion (GCONV=1E-8) satisfied.
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? Fit Statistics
? ? ? ? ? ? ? -2 Log Likelihood ? ? ? ?1653.90 ?<------------------
this line!!
? ? ? ? ? ? ? AIC (smaller is better) ?1663.90
? ? ? ? ? ? ? AICC (smaller is better) 1664.33
? ? ? ? ? ? ? BIC (smaller is better) ?1673.25
? ? ? ? ? ? ? CAIC (smaller is better) 1678.25
? ? ? ? ? ? ? HQIC (smaller is better) 1667.43
? ? ? ? ? ? ?Fit Statistics for Conditional Distribution
? ? ? ? ? ? ?-2 log L(SdlFinal | r. effects) ? 1436.44
? ? ? ? ? ? ?Pearson Chi-Square ? ? ? ? ?908.07
? ? ? ? ? ? ?Pearson Chi-Square / DF ? ? ? ?6.31
? ? ? ? ? ? ? ? Covariance Parameter Estimates
? ? ? ? ? ?Cov ? ? ? ? Standard ? ? Z
? ? ? ? ? ?Parm ?Estimate ? ?Error ? Value ? Pr > Z
? ? ? ? ? ?ID ? ?1.2491 ? 0.2746 ? 4.55 ? <.0001
? ? ? ? ? ? ? ? Solutions for Fixed Effects
? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?Standard
? ? Effect ? ? ? ? Estimate ? ?Error ? ?DF ?t Value ?Pr > |t|
? ? Intercept ? ? ? ? ? 4.5696 ? 0.4333 ? ?47 ? ?10.55 ?<.0001
? ? lnsdlmaxd ? ? ? ? ?-0.6594 ? 0.05717 ? 93 ? -11.53 ?<.0001
? ? lnadultssdld ? ? ? -0.6453 ? 0.1593 ? ?93 ? -4.05 ? 0.0001
? ? lnsdlmaxd*lnadultssd0.07394 ?0.02174 ? 93 ? ?3.40 ? 0.0010